GChemPaint on molekyylien kemiallisten rakenteiden piirtämiseen tarkoitettu ohjelma. Erityisen hyvin se sopii orgaanisen kemian molekyylien rakennekuvien piirtämiseen. Tässä ohjeessa tutustutaan ohjelman perustoimintoihin ja valmiiden rakennemallien hyödyntämiseen.
[[GChemPaint]] on molekyylien kemiallisten rakenteiden piirtämiseen tarkoitettu ohjelma. Erityisen hyvin se sopii orgaanisen kemian molekyylien rakennekuvien piirtämiseen. Tässä ohjeessa tutustutaan ohjelman perustoimintoihin ja valmiiden rakennemallien hyödyntämiseen.
Ennen ohjelman käyttöön ottamista on huomioitava, että GChemPaint on vielä nuori ja kehityksen alla oleva ohjelmisto. Ohjelma on tällä hetkellä saatavilla vain englanninkielisenä ja etenkin varnhemmat versiot voivat olla epävakaita.
Ennen ohjelman käyttöön ottamista on huomioitava, että GChemPaint on vielä nuori ja kehityksen alla oleva ohjelmisto. Ohjelma on tällä hetkellä saatavilla vain englanninkielisenä ja etenkin varnhemmat versiot voivat olla epävakaita.
Nykyinen versio 23. toukokuuta 2010 kello 03.15
GChemPaint on molekyylien kemiallisten rakenteiden piirtämiseen tarkoitettu ohjelma. Erityisen hyvin se sopii orgaanisen kemian molekyylien rakennekuvien piirtämiseen. Tässä ohjeessa tutustutaan ohjelman perustoimintoihin ja valmiiden rakennemallien hyödyntämiseen.
Ennen ohjelman käyttöön ottamista on huomioitava, että GChemPaint on vielä nuori ja kehityksen alla oleva ohjelmisto. Ohjelma on tällä hetkellä saatavilla vain englanninkielisenä ja etenkin varnhemmat versiot voivat olla epävakaita.
Yksittäisiä atomeita voidaan lisätä työkalurivin lisäyspainikkeen avulla.
Tuplanapsautettaessa painiketta voidaan haluttu alkuaineatomi valita jaksollista järjestelmää muistuttavasta ikkunasta.
Tämän jälkeen atomi lisätään napsauttamalla työtilaa. GChemPaint lisää automaattisesti esimerkiksi yksittäisen hiilen ympärille kuuluvat vetyatomit. Esimerkkikuvassa on malliksi lisätty hiiliatomi jonka jälkeen GChemPaint on automaattisesti lisännyt sen ympärille tarvittavat vetyatomit ja muodostanut näin metaani-molekyylin.
GChemPaint sisältää valmiiksi useita monimutkaisempia molekyylejä jotka voidaan lisätä käsiteltäviksi valikosta valitsemalla. Tämä tapahtuu seuraavasti.
Valitaan työkalurivin valikosta haluttu molekyyli (esimerkissä bentseeni)
Napsautetaan mallin lisäämiseen käytettävän työkalun kuvaketta
Napsautetaan työtilassa kohtaa johon molekyyli lisätään
Tämän jälkeen haluttu molekyyli on saatu lisättyä.
Molekyylien välisiä sidoksia tehdään työkalurivillä olevien sidostyökalujen avulla.
Lisää tai tee halutut rakenneosat
Valitse haluttu sidostyökalu
Vedä sidos rakenneosasta toiseen
Esimerkkikuvassa on lisätty metaani ja bentseeni-molekyylit ja yhdistetty ne yksinkertaisella sidoksella. GChemPaint piilottaa metyyliryhmäksi muuttuneen metaanin automaattisesti.
Metaani ja bentseeni molekyylit erillisinä
Bentseeni ja metaani liitettyinä yksinkertaisella sidoksella
Molekyylien rakennekuvia piirrettäessä GChemPaint on hyvä työväline reaktioyhtälöiden tekemiseen tai jos molekyylirakenteita halutaan esimerkiksi tekstinkäsittelyn sekaan. Mikäli samoja, jo kertaalleen piirrettyjä molekyylejä halutaan tarkastella kolmiulotteisesti Ghemical-ohjelmistolla ei ole välttämätöntä piirtää niitä kokonaan uudelleen.
