Gnuplot
Gnuplot on ammattitasoinen komentorivipohjainen ohjelma funktioiden kuvaajien ja numeerisen datan piirtämiseen 2D- tai 3D-esityksiksi. Sitä käytetään yleisesti esimerkiksi tuottamaan kuvaajia tieteellisiin artikkeleihin.
Peruskäyttö
Gnuplotin voi käynnistää komentoriviltä, jonka jälkeen gnuplot>-kehotteen perään syötetään tulostuskäskyt yksi kerrallaan. Monimutkaisemmat tulosteet kannattaa kuitenkin tehdä erillisiksi ajettaviksi tiedostoiksi.
Gnuplot käynnistetään komennolla
gnuplot
jonka jälkeen aukeaa ohjelman päänäyttö, ja yleensä kerrotaan, että käytetään "x11":a eli graafista käyttöliittymää kuvaajien piirtämiseen (Gnuplot osaa piirtää tarvittaessa myös tekstimuotoisia kuvaajia):
G N U P L O T -- Terminal type set to 'x11' gnuplot>
Seuraavaksi voidaan kirjoittaa Gnuplotin komentoja ohjelman omaan käyttöliittymään. Tavallinen kuvaaja xy-koordinaatistoon piirretään komennolla plot funktio, esimerkiksi:
gnuplot> plot sin(x)/x
Jos halutaan piirtää useampia funktioita, erotellaan ne pilkulla:
plot x,sin(x),sin(x)/x
Piirtyvässä ikkunassa kuvaajat ovat oletuksena erivärisiä ja värien selitykset löytyvät oikeasta ylänurkasta.
Alueen rajaaminen
Piirtoalue voidaan rajata tietylle välille seuraavasti:
set xrange [0:10]
Tämä piirtäisi funktion kuvaajan, kun 0<=x<=10. Vastaavasti alue voidaan rajoittaa myös y:n arvojen suhteen komennolla
set yrange [3:4]
jolloin kuvaajasta piirrettäisiin se osa, jossa y-koordinaatti on välillä 3<=y<=4.
Potenssit
Gnuplotin kanssa käytetään potenssimerkkinä kahta kertomerkkiä, esimerkiksi kuvaaja y=x^2 piirrettäisiin komennolla
plot x**2
Piirtäminen parametriesityksestä
Gnuplot mahdollistaa myös funktioiden esittämisen parametrimuodossa. Aluksi on asetettava Gnuplot parametritilaan komennolla
set parametric
Nyt voidaan piirtää kuvaaja syntaksilla
plot [alaraja:yläraja] x(t),y(t)
Esimerkiksi piirretään ellipsin, jonka vaakasuora puoliakseli on 2 ja pystysuora 1:
plot [0:pi*2] 2*cos(t),sin(t)
Komennot
Komento | Selitys |
exit/quit | Lopettaa ohjelman |
cd | Vaihtaa työhakemistoa |
pwd | Näyttää nykyisen hakemiston |
set | Muuttaa asetuksia |
show | Näyttää asetuksien nykyisiä arvoja |
plot | Piirtää 2D-kuvaajan |
splot | Piirtää 3D-kuvaajan |
replot | Suorittaa uudelleen edellisen plot/splot-komennon |
fit | Sovittaa käyrän pistejoukkoon |
save | Tallentaa muuttujia, funktioita ja asetuksia |
load | Lataa save-komennolla tallennetun tiedostoston |
reset | Palauttaa oletusasetukset |
pause | Tauko |
Tulostus tiedostoon
Gnuplot osaa piirtää kuvaajat myös tiedostoon. Se onnistuu valitsemalla päätteen tyypiksi esimerkiksi png komennolla
set term png
Muita mahdollisia arvoja ovat esimerkiksi jpeg, postscript ja latex. Täydellisen listan saat näkyviin komennolla help set term.
Tämän jälkeen asetetaan tulostettavan tiedoston nimi komennolla
set output "tiedosto.png"
Lopulta kuvaajan tulostaminen tähän tiedostoon tapahtuu normaalisti komennolla plot.
Numeerisen datan piirtäminen ja käyrän sovitus pistejoukkoon
Gnuplot osaa sovittaa mielivaltaisia käyriä pistejoukkoon ja se osaa huomioida myös pisteiden virherajat. Pisteet annetaan omassa tiedostossa, jossa jokaisella rivillä on joko välilyönnillä tai sarkaimella (tabulaattorilla) erotettuna pisteen koordinaatit ja mahdollisesti myös virherajat.
Esimerkiksi sovitetaan suora seuraavaan, suunnilleen lineaariseen pistejoukkoon. Tehdään tiedosto mittaus.dat seuraavalla tavalla:
#mittaus.dat #x y xvirhe yvirhe 3 68 0.1 1 4 71.2 0.2 2 5 70 0.15 6 5.5 76.6 0.1 0.5 7.1 81.1 0.2 1 8.2 86.5 0.2 2 9 89 2 3
Nyt tämä pistejoukko voitaisiin yksinkertaisesti piirtää plot-komennolla seuraavasti
plot "mittaus.dat"
Jolloin Gnuplot piirtää pisteet ja valitsee alueen rajat siten, että kaikki pisteet mahtuvat alueelle.
Kuvaan saadaan näkymään virheet lisäämällä komennon perään tekstin with xyerrorbars. with-komennolla on mahdollista lisätä kuvaajaan muitakin elementtejä. Esimerkiksi seuraavat elementit ovat mahdollisia:
Elementti | Selitys |
xyerrorbars | Virherajat x- ja y-suunnassa |
xerrorbars, yerrorbars | Vain x- tai y-suuntaiset virerajat |
lines | Viiva pisteestä pisteeseen |
boxxyerrorbars | Virherajat laatikkoina |
points | Datapisteet (oletus) |
Varsinainen sovitus
Jos piirrämme pistejoukkoon käyrän komennolla
plot "mittaus.dat" with lines
huomataan, että pisteet ovat likimain samalla suoralla, mutta kuvaajassa pisteet on vaan yhdistetty toisiinsa mutkittelevalla viivalla. Voimme kuitenkin sovittaa tähän pistejoukkoon suoran tai minkä tahansa mielivaltaisen funktion seuraavasti.
Määritellään ensin sovitettava funktio f(x):
f(x)=A*x+B
y=A*x+B siis on suoran yhtälö, joten olemme sovittamassa suoraa. Gnuplot selvittää vakiot A ja B.
Varsinainen sovitus tehdään komennolla
fit f(x) "mittaus.dat" via A,B
Eli fit-komennolle annetaan funktio, joka sovitetaan pistejoukkoon ja via-komennolla kerrotaan vakiot, jotka Gnuplotin tulee selvittää.
Tämä komento tulostaa paljon tekstiä kertoen etenemisestään ja kertoo lopulta, millaiseen käyrään se päätyi:
Final set of parameters Asymptotic Standard Error ======================= ========================== A = 3.66307 +/- 0.3708 (10.12%) B = 55.6119 +/- 2.34 (4.208%) correlation matrix of the fit parameters: A B A 1.000 B -0.946 1.000
Eli pistejoukkoon sovitetun suoran yhtälö on 3,66307*x+55,6119. Kulmakertoimen virhe on +/- 0,3708 ja vakiotermin +/- 2,34.
Nyt kun sovitus on tehty, voidaan sovitettu kuvaaja piirtää komennolla
plot f(x)
Sillä fit-komento on asettanut f(x):n vakioille A ja B arvot. Jos samaan kuvaan halutaan piirtää myös datapisteet ja niiden virherajat, komento on
plot "mittaus.dat" with xyerrorbars,f(x)
Tässä siis piirretään kaksi kuvaajaa, jotka erotetaan toisistaan pilkulla.
Virherajojen huomioiminen sovituksessa
Oletuksena Gnuplot ei huomioi pisteille asetettuja virhetermejä käyrää sovittaessaan. Sovitukseen voidaan kuitenkin asettaa jokaista pisteparia vastaamaan tietty painokerroin joka kuvaa pisteen virherajoja. Sovituksessa annettava virhetermi on y-koordinaatin keskihajonta/virhe (kuten monet muutkin sovitusohjelmat, Gnuplot osaa huomioida vain y-koordinaatin virheen). Gnuplot asettaa pisteparin painokertoimeksi 1/s^2, missä s on annettu virhe.
Käytännössä tämä tapahtuu siten, että sovituskomennossa kerrotaan Gnuplotille, missä tiedoston sarakkeessa virhetermi on. Jos edellä olevassa esimerkissä päättäisimme, että voimme jättää x-koordinaatin virheen huomioon ottamatta, kertoisimme virheen olevan tiedoston 4. sarakkeessa jolloin sovitus tapahtuisi komennolla
fit f(x) "mittaus.dat" using 1:2:4 via A,B
Tässä siis parametri using 1:2:4 kuvaa tiedoston rakenteen: ensimmäisessä sarakkeessa on x-koordinaatti, toisessa y-koordinaatti ja neljännessä y-koordinaatin keskihajonta.
Lisätietoja sovitustoiminnosta löytyy Gnuplotin ohjeista komennolla
help fit