Java/Ubuntu
Ubuntu suosittelee OpenJDK-pakettien käyttöä. Paketit löytyvät jakelun main-haarasta. Sunin Javan (nykyään Oraclen) tuki ollaan lopettamassa, koska Oracle ei enää salli jakeluiden jaella sitä.
OpenJDK
OpenJDK löytyy Ubuntun virallisesta main-haarasta eli niiden asennuksessa ei pitäisi olla mitään kommervenkkejä. Selain-plugin on nimeltään icedtea6-plugin, virtuaalikoneella on vaihtoehtoina openjdk-6-jdk ja openjdk-6-jre.
Sun Java
Sunin "virallisen", osittain suljetun lähdekoodin Java-toteutus on sisältynyt pakettilähteeseen multiverse. Koska Oracle ei enää salli uusien versioiden jakelua ja pahoja turva-aukkoja on löytynyt, Ubuntu on julkaissut päivityksen joka poistaa paketit käytöstä ja on korvaamassa nämä paketit tyhjillä paketeilla, jotka siis poistavat Sunin Javan koneelta.
Jos Sunin Javaa haluaa jatkossa käyttää, se pitää asentaa Oraclen sivuilta. Tai käyttää epävirallista päivityspakettia, jonka tarkoituksena on automaattisesti hakea ja asentaa tarvittavat tiedostot. Sen toiminta on samantyyppinen kuin Flashin asennusohjelma. Eli update-sun-jre on ajettava skripti, joka lataa Internetistä Oracle Javan, koska Oracle ei ole antanut lupaa paketoida sitä suoraan pakettiin.
deb http://www.duinsoft.nl/pkg debs all sudo apt-key adv --keyserver keys.gnupg.net --recv-keys 5CB26B26
sudo apt-get update sudo apt-get install update-sun-jre